Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RykQ01887 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RykQ01887 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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