Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itga4Q00651 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms