Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nbr1P97432 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms