Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb13P70321 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms