Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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