Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Strn4P58404 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Strn4P58404 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms