Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nedd1P33215 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms