Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmnb1P14733 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms