Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms