Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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PtprcP06800 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PtprcP06800 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PtprcP06800 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PtprcP06800 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PtprcP06800 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PtprcP06800 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprcP06800 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms