Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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