Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2888K7N746 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms