Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lipo1J3QME6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms