Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pagr1bF6V0H0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pagr1bF6V0H0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms