Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms