Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nectin3Q9JLB9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Nectin3Q9JLB9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Nectin3Q9JLB9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Nectin3Q9JLB9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Nectin3Q9JLB9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Nectin3Q9JLB9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nectin3Q9JLB9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nectin3Q9JLB9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nectin3Q9JLB9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nectin3Q9JLB9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Nectin3Q9JLB9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms