Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scube2Q9JJS0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scube2Q9JJS0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms