Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms