Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc3Q9CXE6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms