Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BccipQ9CWI3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms