Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PsenenQ9CQR7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms