Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nsmce3Q9CPR8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nsmce3Q9CPR8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nsmce3Q9CPR8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nsmce3Q9CPR8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nsmce3Q9CPR8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nsmce3Q9CPR8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nsmce3Q9CPR8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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