Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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