Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms