Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FgbQ8K0E8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms