Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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