Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hirip3Q8BLH7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms