Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mindy1Q76LS9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mindy1Q76LS9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mindy1Q76LS9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mindy1Q76LS9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mindy1Q76LS9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mindy1Q76LS9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mindy1Q76LS9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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