Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Fndc3c1Q6DFV6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fndc3c1Q6DFV6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fndc3c1Q6DFV6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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