Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gja3Q64448 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms