Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf180Q3U827 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf180Q3U827 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf180Q3U827 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf180Q3U827 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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