Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrp1aQ2LKU9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms