Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sox10Q04888 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sox10Q04888 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms