Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cacna1cQ01815 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms