Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cbx1P83917 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms