Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rps28P62858 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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