Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

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Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Vcam1P29533 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Vcam1P29533 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Vcam1P29533 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vcam1P29533 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vcam1P29533 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vcam1P29533 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vcam1P29533 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vcam1P29533 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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