Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms