Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm4340L7N2C4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4340L7N2C4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4340L7N2C4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4340L7N2C4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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