Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20425E9Q035 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms