Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf11bB4XVQ1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Phf11bB4XVQ1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms