Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zscan5bB2RTN3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms