Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1jA2BFR3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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