Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cml5Q9QXS8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cml5Q9QXS8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms