Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Capn12Q9ER56 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Capn12Q9ER56 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn12Q9ER56 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms