Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trmt112Q9DCG9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trmt112Q9DCG9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms