Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms