Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa22Q8C1N8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms