Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Atp8b3Q6UQ17 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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