Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms